La composition des enveloppes fluides de la Terre (atmosphère et hydrosphère) et la nature des roches de la géosphère ont évolué au cours de l'histoire de la Terre. Les organismes vivants ont contribué à cette évolution, que nous allons appréhender à partir de l'exemple des cyanobactéries.

• Le document 3 indique que les plus anciens stromatolites sont datés d'environ 3,8 Ga (milliards d'années).
• Le document 1 montre qu'un stromatolite est constitué de lamelles calcaires superposées. Celles-ci matérialisent une croissance du stromatolite en couches successives. La surface de ces formations présente un tapis formé de bactéries, dont les plus remarquables sont des cyanobactéries qui sont responsables de la construction des stromatolites.
• Le document 1 indique que les cyanobactéries sont constituées de filaments formés par l'association de cellules procaryotes chlorophylliennes enrobées dans un mucus. Cet ensemble permet de piéger des particules sédimentaires minérales. En outre, les cyanobactéries sont responsables d'un dépôt de calcaire qui soude entre elles les particules minérales, formant ainsi une nouvelle lamelle.
• Le document 2 permet de comprendre le rôle des cyanobactéries dans la précipitation des carbonates (CaCO₃) :

• les cyanobactéries chlorophylliennes réalisent la photosynthèse qui assure la production de matières organiques à partir de matières minérales (CO₂ et H₂O)
• dans l'eau où elles vivent, se trouvent du CO₂ et des ions HCO₃^- solubles. En réalisant la photosynthèse, les cyanobactéries appauvrissent l'eau de leur environnement en dioxyde de carbone. Dans cette situation, l'équation proposée se lit de gauche à droite et aboutit à la précipitation des carbonates.

• Le document 1 indique que les filaments de cyanobactéries emprisonnées dans la couche minérale formée meurent pour la plupart. Sur ce substrat, une nouvelle association bactérienne s'installe et sera à l'origine d'une nouvelle lamelle. Les stromatolites fossiles et les stromatolites actuels ayant la même organisation, on peut, en appliquant le principe de l'actualisme, affirmer que dès - 3 Ga,des êtres vivants ont participé à la formation de roches calcaires.

• Le document 3 indique que les gisements de fers rubanés se sont formés entre - 3,5 Ga et - 1,9 Ga. Ils constituent les principaux gisements de fer mondiaux. Durant leur formation, l'atmosphère ne contenait pas de dioxygène, ou très peu (entre - 2 et - 1,9 Ga). Ils sont exclusivement d'origine marine.
• Durant toute la période de formation des gisements de fers rubanés, l'océan contenait des ions ferreux (Fe²⁺) solubles, provenant de l'érosion des continents. La présence de minerais de fer (oxyde ferrique Fe₂O₃) dans les formations rubanées ne peut s'expliquer que par l'oxydation des ions ferreux en oxydes ferriques Fe₂O₃insolubles, ce qui implique la présence de dioxygène dans l'eau de mer.
• L'atmosphère ne contenant pas de dioxygène, la seule source possible est le dioxygène libéré par la photosynthèse des cyanobactéries, seuls organismes photosynthétiques existant à cette époque. Ce dioxygène était immédiatement consommé par l'oxydation des ions ferreux en oxyde ferrique.

Indirectement, les cyanobactéries, êtres vivants, ont donc contribué à la formation de roches sédimentaires (carbonates et minerais de fer). Ainsi, la biosphère a influencé la composition de la géosphère.

• Le document 3 confirme que, pendant les deux premiers milliards d'années, l'atmosphère primitive ne contenait pas de dioxygène. Celui-ci est apparu à partir de - 2 Ga, et sa teneur a considérablement augmenté à partir de - 1 Ga jusqu'à - 0,5 Ga.
• Ce dioxygène ne peut provenir que d'organismes photosynthétiques. Jusqu'il y a environ 500 millions d'années, ces organismes étaient uniquement aquatiques. Le dioxygène est donc apparu d'abord dissous dans l'eau, et c'est par les mécanismes physiques de diffusion des gaz entre deux milieux (eau et air) qu'il est apparu dans l'atmosphère.

• À partir de - 2 Ga, la présence de dioxygène dans l'eau des océans et dans l'atmosphère implique que sa production par les êtres vivants photosynthétiques a été plus grande que sa consommation par oxydation de matériel minéral.
• L'évolution de la composition de l'atmosphère n'a pas concerné que le dioxygène. L'atmosphère primitive était très riche en dioxyde de carbone, dont la teneur a considérablement diminué : le CO₂ a été piégé sous forme de carbonates, et l'exemple des stromatolites montre que des êtres vivants chlorophylliens sont non seulement à l'origine du dioxygène des enveloppes fluides, mais ont aussi, en provoquant la production de carbonates, contribué à la diminution de la concentration en dioxyde de carbone de l'atmosphère.

Cet exemple des stromatolites montre comment des organismes photosynthétiques appartenant à la biosphère ont contribué à modifier à la fois la géosphère, l'hydrosphère et l'atmosphère qui, elles-mêmes, sont en interaction permanente.