Le déficit en lactase, ou intolérance au lactose, correspond à une absence ou une diminution partielle de l'activité de la lactase, enzyme qui hydrolyse le lactose en glucose et galactose.
En cas d'alactasie, l'organisme est incapable de digérer des quantités importantes de lactose : celui-ci, ne pouvant être absorbé, reste dans la lumière du tube digestif. Il en résulte :
une fermentation du lactose par le microbiote, produisant des gaz à l'origine de ballonnements et de douleurs abdominales ;
une augmentation de la pression osmotique dans le tube digestif liée à la présence du lactose dans le tube digestif, responsable d'une diminution de l'absorption de l'eau par osmose, à l'origine des diarrhées.